U.C.0079年，吉恩公国发动了对地球联邦的全面战争，双方在宇宙和地球上展开了激烈的对抗。地球联邦军为了抵抗拥有新型兵器机动战士（MS）的吉恩军，也开始了自己的MS开发计划。其中一项是RX-79 [G]陆战用先行量产型高达，这是RX-78高达的量产型，专门用于地球上的作战，分配给了一些精英的MS小队。天田士郎是一名年轻的联邦军少尉，从宇宙殖民卫星赶赴地球东南亚战场，途中遇到了吉恩军的新型MS，与之交战。在战斗中，他和敌方的女驾驶员爱娜·萨哈林不期而遇，两人因为共同的危机而互相帮助，渐生情愫。但他们并不知道，对方的身份是自己的敌人。天田士郎到达地球后，被任命为第08MS小队的队长，这是一个由四名MS驾驶员和两名通讯员组成的精锐部队，装备了三台陆战型高达。他和他的队友们在丛林、沙漠、雪山等各种地形上执行各种任务，与吉恩军展开了多次激战。在战斗中，他们不仅要面对敌人的威胁，还要面对战争的残酷和无意义，以及自己的信念和良心。爱娜·萨哈林是吉恩公国名门萨哈林家的千金，她的哥哥基尼亚斯·萨哈林是吉恩军的技术将领，负责开发一种巨型的机动装甲（MA），名为阿普薩拉斯。这是一个秘密的计划，旨在改变战局，也是基尼亚斯为了复兴萨哈林家族的野心。爱娜作为阿普薩拉斯的试飞员，多次与天田士郎和第08MS小队交战，但她对天田士郎的感情却越来越深。她也发现，她的哥哥为了完成阿普薩拉斯，不惜牺牲自己的身体和理智，甚至不顾自己的部下和同胞的生命。天田士郎和爱娜·萨哈林，两个身处敌对阵营的恋人，能否在战争的洪流中保持自己的爱情？第08MS小队，一个由不同性格和背景的战士组成的团队，能否在战争的磨难中活下来？一年战争，一个改变了人类历史的战争，能否给予他们一个和平的未来？这些问题的答案，就在《机动战士高达 第08MS小队》这部动漫中。